W 2002 roku Walne Zebranie uchwaliło poprawkę do Statutu Stowarzyszenia POLARIS - OPP powołującą komórki wewnątrz-organizacyjne zwane jako działy tematyczne Polarisu. Ich zadaniem od tego czasu jest koordynowanie prac Stowarzyszenia w określonej tematyce lub wybranym zagadnieniu nawiązującym do ogólnych celów statutowych. Działy stanowią jednak przede wszystkim za wsparcie merytoryczne podczas realizacji projektów dotacyjnych i zadań specjalnych. Każdy dział posiada co najmniej jednego koordynatora wybieranego na roczną kadencję przez Walne Zebranie lub w przypadku braku chętnych, prowadzony jest przez Zarząd Stowarzyszenia (zawieszany).

Od 2017 roku każdy, aktywny dział otrzymuje na swoje funkcjonowanie kwotę 1000zł. z budżetu Stowarzyszenia w ramach Programu 1000+. Oprócz tego realizując projekty lub działania odpłatne statutowe działy zyskują sprzęt, wyposażenie bieżące, materiały, a nawet wynagrodzenie dla prowadzących ich koordynatorów.  

Aktualnie swoich koordynatorów posiadają następujące działy tematyczne: